Η λέξη Ομακοείο είναι σύνθετη και αποτελείται από το “ομού (μαζί) ακούμε” την “Εσωτερική Διδασκαλία”, έννοια που εμπεριέχει τον ιερό υπέρτατο ήχο του “ΟΜ”.
Το Ομακοείο ιδρύθηκε αρχικά από τον Πυθαγόρα, στον Κρότωνα της Νότιας Ιταλίας, της Μεγάλης Ελλάδας τότε, στα μέσα του 6ου π.Χ. αιώνα.